Институт стран СНГ (Институт диаспоры и интеграции) был создан 11 апреля 1996 году в форме автономной некоммерческой организации. Среди учредителей Института: МГУ им. М.В. Ломоносова, МГИМО МИД РФ, институты Российской академии наук (славяноведения; этнологии и антропологии; Европы).

С момента основания Института в круг его задач входит изучение постсоветского пространства, научно-аналитическое и общественно-политическое сопровождение внешнеполитической деятельности Российской Федерации в ближнем зарубежье, а также российской диаспоральной политики, мониторинг и прогнозирование внутренней и внешней политики бывших союзных республик, анализ моделей экономической, политической, военной и культурной интеграции на постсоветском пространстве. Большое значение Институт уделяет сбору и обработке информации о положении соотечественников в ближнем зарубежье, укреплению связей с российской диаспорой за рубежом. Одно из приоритетных направлений деятельности Института — мониторинг этно-социальных и военно-политических конфликтов на территории бывшего СССР, выработка рекомендаций по их разрешению и предотвращению.

До сих пор Институт является единственным российским научным учреждением, обеспечивающим всестороннее и комплексное исследование социально-политических и экономических процессов на постсоветском пространстве и проблем российских соотечественников.

В число основных пользователей информационно-аналитических докладов, исследований и прогнозов Института входят: Государственная Дума и Совет Федерации РФ, МИД РФ, Совет безопасности РФ, Администрация Президента РФ, Министерство культуры РФ, Минэкономразвития РФ, исследовательские центры Российской академии наук, неакадемические государственные институты, аналитические центры, крупные бизнес-структуры, имеющие интересы на постсоветском пространстве.

Структура  Института в полной мере отражает специфику и  направления его деятельности. В Институте работают отделы:  Украины, Белоруссии, Кавказа, Молдовы и Приднестровья, Средней Азии и Казахстана, Диаспоры и миграции, Евразийских исследований и ШОС, Отдел по связям с РПЦ и православным сообществом за рубежом, Исламских исследований, Сравнительного законодательства, Экономических исследований.